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作为一名在凝聚态物理领域享有国际声誉的实验物理学家，薛其坤曾两次受邀在诺贝尔论坛作特邀报告。此外，他所获得的凝聚态物理最高奖——奥利弗·巴克利奖和国际低温物理最高奖——菲列兹·伦敦奖，均是第一次颁给中国籍的物理学家。清华大学副校长姜培学称其“是改革开放以来我国在基础研究领域取得国际引领性重大科学突破的杰出科学家之一”。

与众多荣誉相比，可能不值一提的是，薛其坤还是做扫描探针针尖的能手。要做好扫描隧道显微镜实验，必须要拥有制备很好的扫描探针针尖的能力。在薛其坤读书期间，他每天至少要试做3个针尖，两年下来就做了1000多个针尖。那时，实验所购买的针尖并不好用，薛其坤能做出一个既尖又皮实又稳定的针尖千百网最新，“当时全世界可以做好的不到10个人，我是其中之一”。后来，在实验室里，学生都不敢和薛其坤比赛做针尖。

2005年11月，薛其坤成了中国科学院当批年纪最小的“新科院士”。在来到清华物理系后，他与研究团队开始对一个世纪难题——高温超导机理展开攻关。在重重质疑面前，一度“发论文都很难”。2012年，薛其坤团队发现单层硒化铁与钛酸锶衬底结合而产生出界面高温超导，颠覆了国际主流共识。薛其坤计划，要在这一领域继续取得新的“中国发现”。

未来薛其坤还要追寻新的课题。一方面要探索高温量子反常霍尔效应以及有可能的应用。另外，还要探索量子反常霍尔效应及其有关的量子态在拓扑量子计算方面的应用。此外继续开展高温超导机理研究。薛其坤进一步解释，“人们仍然没有理解高温超导的机理，可以说，这是个凝聚态物理学的世纪难题。我们的研究团队目前一个重要科学目标就是高温超导机理”。