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除了门诊时间，吴建华经常沉浸在手术室里“埋头苦干”。有时一天的手术量高达十几台，时间长达七八个小时，期间背部一直要保持笔直，对颈、背、腰等都造成了很大的压力，但他仍忍着腰椎、颈椎之痛坚持做手术。据不完全统计，吴建华已完成手术台次超万例以上，精湛高超的医术深得眼底病患者好评，早已成为患者口耳相传的“复明大神”。

目前，武汉大学附属爱尔眼科医院承担了湖北省科技厅项目2项、湖南省科技厅项目15项、湖北省卫健委项目12项、武汉市卫健委项目58项。产出科研成果专利96项，软件著作权13项，科技论文343余篇(含SCI期刊论文67余篇)，编出版医学专著13本。主办国家级医学继续教育项目10个，省级继续教育项目20个，市级继续教育项目8个。2022年8月4日，由中国医学科学院主办的2021年度中国医学院校/中国医院科技量值(STEM)暨五年总科技量值(ASTEM)发布，医院荣登全国眼科学榜百强。

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